Применение упрощенной системы налогообложения в случае с НКО имеет ряд своих особенностей, связанных в том числе с недавней налоговой реформой. Разберем все по порядку.
1. НКО на УСН, имеющие нецелевой доход, освобождены от налога на прибыль, а также на имущество.
2. Для некоторых категорий НКО на УСН в 2026 году действуют пониженные тарифы страховых взносов в размере 7,6 % с выплаты в пределах единой предельной базы и 0% с выплат сверх предельной базы. Право на такую льготу теоретически имеют организации, занятые в сферах соцобслуживания, здравоохранения, образования, культуры и искусства, непрофессионального спорта, науки. Кроме того, целевые доходы должны составлять не менее 70% от всех доходов НКО. На практике нормы законодательства, регулирующие этот момент, настолько размыты, что проще всего обратиться с запросом в налоговую по конкретной организации в ФНС - налоговая разъяснит, можно ли конкретному НКО на УСН применять пониженный тариф страховых взносов или нет.
3. НКО, как и любые другие организации, могут использовать два варианта УСН (то есть два объекта налогообложения) на выбор: «Доходы» с базовой ставкой 6% или «Доходы минус расходы» с базовой ставкой 15% со сдачей всей положенной отчетности в ФНС, СФР и Росстат. При этом УСН «Доходы» позволяет НКО снижать сумму налога по итогам каждого квартала за счет уплачиваемых страховых взносов и некоторых других видов выплат сотрудникам (перечислены в
п. 3.1. ст. 346.21 НК РФ), но не более чем наполовину.
4. Ранее УСН освобождала и бизнес, и НКО от обязанности исчислять и уплачивать НДС при годовом доходе менее 60 млн рублей. В ходе налоговой реформы с 1 января 2026 года этот порог снижен до 20 млн рублей. Поэтому НКО на УСН с внереализационным доходом, по итогам 2025 года превысившим эту отметку, теперь автоматически являются плательщиками НДС - ставка в зависимости от выбора может быть стандартной (22%) или пониженной (5-7%). При этом сохраняется правило отсутствия необходимости уплаты НДС с льготных операций по
ст. 149 НК РФ.