Несмотря на то, что товарооборот между странами, входящими в ЕАЭС, предполагает немало экономических преференций для его участников, импортеры не освобождаются от уплаты налога за продукцию, ввезенную на территорию России. Это так называемый таможенный или косвенный НДС, который импортер платит вне зависимости от организационной формы (ООО, ИП) и, что особенно важно (!) режима налогообложения (ОСНО, УСН, ЕНВД, ЕСХН, патент). Однако по состоянию на сегодняшний день такая обязанность возникает только если импортер является собственником товара или посредником, действующим в интересах собственника. А с 2025 года таможенный НДС будут уплачивать также посредники, действующие в интересах зарубежной компании, которая собирается продавать свой товар в РФ.
Если же ввоз продукции осуществляется для личных нужд, а не для продажи, идет товарооборот между структурами одной и той же организации, товар относится к специальной категории, не подлежащей налогообложению (это могут быть уникальные медицинские изделия, компоненты для лекарственных препаратов и другие — список указан в ст. 150 НК РФ) или приобретен у российской организации, расположенной на территории другой страны — члена ЕАЭС, НДС уплачивать не потребуется. Все случаи, в которых налог при импорте не взимается, перечислены в следующих документах: п. 6 статьи 72 Договора о ЕАЭС, п. 13 и 25 приложения 18 к Договору о ЕАЭС, ст. 151 НК РФ.